近日,中國農(nóng)業(yè)科學院北京畜牧獸醫(yī)研究所牛遺傳育種科技創(chuàng)新團隊利用牛胎兒骨骼肌成肌分化體外模型,揭示了牛骨骼肌發(fā)育過程中的染色質(zhì)可及性和轉(zhuǎn)錄動態(tài)調(diào)控模式。相關(guān)研究成果發(fā)表在《細胞增殖(Cell Proliferation)》(IF=6.831)上。
骨骼肌的生長發(fā)育直接影響肉牛生長速度和肉質(zhì),胎兒期骨骼肌的發(fā)育對肉牛后天生長發(fā)育有重要且長期的影響。然而,當前對于肉牛骨骼肌生長發(fā)育這一重要性狀的基因組表觀調(diào)控機制仍不清楚。
研究人員利用牛胎兒骨骼肌分離、純化出成肌細胞并誘導分化,利用ATAC-seq和RNA-seq技術(shù)獲得了成肌細胞增殖分化全過程的染色質(zhì)可及性和基因表達信息。分析發(fā)現(xiàn),牛成肌細胞體外增殖和分化過程中染色質(zhì)可及性和基因表達呈現(xiàn)動態(tài)變化。研究還鑒定出階段特異性基因和染色質(zhì)可及性區(qū)域,揭示了參與牛成肌細胞增殖和分化的關(guān)鍵基因、轉(zhuǎn)錄因子及信號通路的時序性調(diào)控模式。整合轉(zhuǎn)錄組和GWAS結(jié)果,從基因組、表觀組及轉(zhuǎn)錄組多個層面探究了牛重要經(jīng)濟性狀基因組調(diào)控位點與基因組染色質(zhì)開放區(qū)的關(guān)系。
該研究得到了中國農(nóng)業(yè)科學院創(chuàng)新工程、國家肉牛牦牛產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系、國家自然科學基金等項目的資助。李倩和王亞慧為論文共同第一作者,李俊雅研究員和張路培研究員為通訊作者。
原文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/cpr.13219