張莉研究員介紹，驢是草食動(dòng)物，屬馬科家畜，是肉食、阿膠、奶制品及驢副產(chǎn)品等的重要來(lái)源，在精準扶貧和鄉村振興中發(fā)揮著(zhù)重要作用。但驢產(chǎn)業(yè)發(fā)展始終受到養殖科技水平低、育種體系不完善等問(wèn)題的制約。本研究以德州驢2個(gè)品系的背最長(cháng)肌和臀肌為研究對象進(jìn)行lncRNA建庫測序，共獲得24,683個(gè)基因和49,265條轉錄本，經(jīng)過(guò)比對共鑒定到3869個(gè)新的lncRNA。經(jīng)過(guò)不同組間的比較分析獲得了差異表達的lncRNA，并構建了lncRNA-miRNA-mRNA相互作用網(wǎng)絡(luò )，發(fā)現了3個(gè)重要的關(guān)鍵候選lncRNA（MSTRG.9787.1, MSTRG.3144.1, MSTRG.9886.1）和4個(gè)關(guān)鍵候選基因（ACTN1, CDON, FMOD, BMPR1B）。通過(guò)KEGG生物信息學(xué)分析，發(fā)現TGF-β信號通路在德州驢肌肉發(fā)現中發(fā)揮重要作用。該研究為提高驢養殖效率、培育肉用驢新品種、促進(jìn)驢產(chǎn)業(yè)轉型升級提供了重要支撐。
相關(guān)研究成果發(fā)表在《基因 （genes）》（IF=“3.759）。碩士生石田培和助理研究員胡文萍為論文的共同第一作者，張莉研究員為通訊作者。該研究得到了院企合作研發(fā)項目《東阿黑驢重要經(jīng)濟性狀功能基因挖掘與鑒定》（2016-YF-05）的支持。
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