在國家重點(diǎn)研發(fā)計劃“藍色糧倉”重點(diǎn)專(zhuān)項、黑龍江省自然科學(xué)基金等項目的資助下,由黑龍江水產(chǎn)研究所鯉科魚(yú)類(lèi)基因組學(xué)科技創(chuàng )新團隊常玉梅等人開(kāi)展的“瓦氏雅羅魚(yú)高堿適應Long Non-coding RNAs的鑒定與分析研究”取得重要進(jìn)展,相關(guān)研究成果“Identification and Analysis of Long Non-coding RNAs inLeuciscus waleckiiAdapted to Highly Alkaline Conditions”發(fā)表于《Frontiers in Physiology》(IF=4.566)(https://doi.org/10.3389/fphys.2021.665268)。
鰓和腎臟是負責調節廣鹽性硬骨魚(yú)體內滲透環(huán)境動(dòng)態(tài)平衡的最重要的器官,為了探索lncRNAs在瓦氏雅羅魚(yú)高堿適應過(guò)程中的潛在作用,本研究對不同堿度處理下的瓦氏雅羅魚(yú)鰓和腎組織進(jìn)行高通量測序,并結合已有的轉錄組數據對結果深入分析。研究發(fā)現大量與顯著(zhù)差異表達lncRNAs表達模式相關(guān)的編碼基因富集于“transporter activity”、“response to stimulus”和“binding”等條目,這些基因與酸堿平衡、離子轉運和氨氮排泄等調節密切相關(guān),表明lncRNAs對相關(guān)基因的調控在瓦氏雅羅魚(yú)的高堿適應性過(guò)程中可能發(fā)揮重要作用。
該研究篩選得到的大量在瓦氏雅羅魚(yú)高堿適應過(guò)程中發(fā)揮重要調控作用的表觀(guān)調控lncRNAs,為深入解析瓦氏雅羅魚(yú)高堿適應的分子機制奠定了基礎。