在國家重點(diǎn)研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金、黑龍江省自然科學(xué)基金等項目的資助下,黑龍江水產(chǎn)研究所鯉科魚(yú)類(lèi)基因組學(xué)團隊常玉梅研究員等人開(kāi)展的瓦氏雅羅魚(yú)在極端鹽堿環(huán)境下的適應性分子機制研究取得重要進(jìn)展,相關(guān)研究成果“Resequencing and SNP discovery of Amur ide (Leuciscus waleckii) provides insights into local adaptations to extreme environments”發(fā)表于《Scientific Reports》(IF=4.379) (https://doi.org/10.1038/s41598-021-84652-5)。
我國內蒙古高原東部達里湖是典型的高碳酸鹽型半咸水湖泊,瓦氏雅羅魚(yú)達里湖種群與其它淡水種群不同,能夠耐受該湖極端的不良環(huán)境并形成優(yōu)勢種群,獨特的地質(zhì)和演化歷史使瓦氏雅羅魚(yú)成為了研究硬骨魚(yú)類(lèi)適應極端環(huán)境的理想模型。該研究采集了達里湖高堿耐受種群、鄰近姊妹湖崗更湖淡水種群、松花江淡水種群個(gè)體,從基因組尺度深入解析達里湖瓦氏雅羅魚(yú)極端鹽堿環(huán)境的適應性機制。通過(guò)深度基因組重測序和遺傳變異信息的挖掘,消除空間背景差異聚焦異質(zhì)水環(huán)境,群體遺傳結構和適應性進(jìn)化研究發(fā)現,一些與離子和滲透壓調節、血管發(fā)育、炎癥免疫反應等過(guò)程相關(guān)的關(guān)鍵基因受到較強的正向選擇壓力,參與鹽堿局域適應。其中達里湖種群的血管活性腸肽受體基因vipr1多個(gè)位點(diǎn)受到強選擇,使其編碼蛋白具有更高效的配體結構域,可能通過(guò)VIPR1-PACAP/VIP-PRL-NCC軸參與Na+/Cl-離子轉運。
該研究揭示了達里湖瓦氏雅羅魚(yú)適應極端環(huán)境的遺傳基礎,也為耐堿魚(yú)類(lèi)新品種選育提供了有價(jià)值、可利用的基因元件。