近日,西北農林科技大學(xué)動(dòng)科學(xué)院動(dòng)物基因組與基因功能研究團隊在中國家驢遺傳結構和體型大小受選擇信號領(lǐng)域取得進(jìn)展,在《Journalof Genetics and Genomics》(中科院1區TOP期刊)上在線(xiàn)發(fā)表了題為《Genomic Analyses Reveal Distinct Genetic Architectures and Selective Pressures in Chinese Donkeys》的研究論文。我院在讀博士研究生沈加飛、于杰和代學(xué)雷為論文的第一作者,黨瑞華副教授為通訊作者。
該研究選取中國家驢12個(gè)代表性地方品種共78個(gè)樣本進(jìn)行全基因組重測序,結合從公共數據庫下載的11個(gè)野驢全基因組數據共同進(jìn)行分析,發(fā)現中國家驢祖先來(lái)源比較單一,但在群體結構上具有明顯的地理分布特征,分為華北平原驢、黃土高原驢和西南高原驢三類(lèi)。
(A)家驢群體結構;(B)家驢NJ樹(shù);(C)家驢選擇信號與基因型分析
為揭示中國家驢體型差異的遺傳機制,研究人員對大型驢、中型驢和小型驢進(jìn)行受選擇分析,在家驢3號染色體上發(fā)現2個(gè)與體高發(fā)育密切相關(guān)的明星基因NCAPG和LCORL,分別有11個(gè)和5個(gè)錯義突變位點(diǎn),共同組成的基因型可以把大型驢與小型驢分開(kāi)。
該研究解析了中國家驢的群體遺傳結構,篩選出影響中國家驢體型大小的關(guān)鍵候選基因與SNP錯義突變位點(diǎn),為揭示中國家驢地方品種的遺傳多樣性、品種形成的遺傳機制及品種改良提供了理論依據。
全文鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1673852721001776