近日，中國農(nóng)業(yè)科學院植物保護研究所作物黃萎病研究團隊與美國加州大學戴維斯分校聯(lián)合牽頭的“全球黃萎病菌基因組研究”計劃取得重要進展，搭建了國際上第一個作物黃萎病菌資源和基因組數(shù)據(jù)庫（Verticilli-Omics）并正式上線。用戶可在該網(wǎng)站查閱收錄的菌種資源信息、測序基因組可視化展示、數(shù)據(jù)挖掘和分析等工作。

 

　　據(jù)戴小楓研究員介紹，大麗輪枝菌是引起作物黃萎病的病原真菌，年均造成損失近百億美元。該病原難以防控的重要原因是種群結(jié)構(gòu)復(fù)雜，農(nóng)業(yè)生產(chǎn)實踐中缺少分子流行檢測技術(shù)。針對這一難題，該團隊聯(lián)合國內(nèi)外16家單位開展協(xié)同攻關(guān)，構(gòu)建了迄今為止來源最豐富的菌種資源庫，發(fā)起了“全球黃萎病菌基因組研究”計劃。目前，團隊已完成了基因組解析工作（全基因組159株、重測序3624株），搭建了Verticilli-Omics數(shù)據(jù)庫1.0版本并開始線上運行。該數(shù)據(jù)庫收錄了來源10個國家26個寄主共8102份黃萎病菌菌種資源；釋放了159個大麗輪枝菌全基因組數(shù)據(jù)，占目前全球已釋放大麗輪枝菌基因組總數(shù)的85%；搭建了基因組可視化、基因功能檢索、基因比對等分析平臺。團隊目前還在搭建Verticilli-Omics數(shù)據(jù)庫2.0版本，主要展示全球大麗輪枝菌遺傳變異組數(shù)據(jù)。

 

　　該研究得到國家重點研發(fā)計劃政府間國際科技創(chuàng)新合作重點專項、中國農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程等項目支持。