近日，豬遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)繪制了涵蓋豬胚胎發(fā)育全期骨骼肌基因組染色質(zhì)開(kāi)放區(qū)域精細(xì)圖譜，鑒定了調(diào)節(jié)肌肉發(fā)育的順式調(diào)控元件及相關(guān)基因，為更好地研究豬胚胎骨骼肌發(fā)育相關(guān)基因的調(diào)控動(dòng)力學(xué)奠定了基礎(chǔ)。相關(guān)研究成果發(fā)表在《畜牧與生物技術(shù)雜志（Journal of Animal Science and Biotechnology）》上。

 

　　據(jù)團(tuán)隊(duì)執(zhí)行首席張龍超博士介紹，豬胚胎肌肉發(fā)育主要集中在兩個(gè)生長(zhǎng)波，即胚胎期35-60天，初級(jí)纖維形成；胚胎期54-90天，次級(jí)纖維生成。發(fā)育過(guò)程中，大量轉(zhuǎn)錄因子通過(guò)與開(kāi)放的靶基因DNA序列結(jié)合來(lái)調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的發(fā)生，進(jìn)而控制骨骼肌發(fā)育進(jìn)程。但由于豬胚胎期骨骼肌基因組范圍染色質(zhì)開(kāi)放性尚不清晰，豬經(jīng)濟(jì)性狀分子機(jī)理解析及基因組育種技術(shù)創(chuàng)新受到制約。為攻克這一瓶頸問(wèn)題，研究人員以大白豬為研究對(duì)象，利用ATAC-seq、RNA-seq等多種組學(xué)研究技術(shù)，獲得了包含45、70和100胚齡時(shí)期骨骼肌表觀遺傳調(diào)控?cái)?shù)據(jù)，并在三個(gè)胚胎時(shí)期分別鑒定出21,638、35,447和60,181個(gè)染色體開(kāi)放區(qū)域。研究還發(fā)現(xiàn)數(shù)個(gè)調(diào)控肌肉發(fā)育相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄因子以及大量轉(zhuǎn)錄阻遏物，為豬功能基因組及性狀調(diào)控機(jī)制研究提供了重要參考。

　　該研究得到中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院創(chuàng)新工程、國(guó)家生豬產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系的資助。

 

　　原文鏈接https://doi.org/10.1186/s40104-021-00577-z