近日,中國農業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫研究所肉羊遺傳育種創(chuàng )新團隊構建了光周期誘導下卵巢摘除及雌激素處理(OVX+E2)綿羊甲狀腺circRNAs圖譜,揭示了甲狀腺組織中在不同光周期下差異表達的關(guān)鍵circRNAs及其調控機制。相關(guān)研究成果發(fā)表于《內分泌學(xué)前沿(Frontiers in Endocrinology)》上。
據肉羊遺傳育種團隊儲明星介紹,綿羊的季節性繁殖受光周期等外界環(huán)境長(cháng)期選擇而形成,光周期變化是影響綿羊季節性繁殖的關(guān)鍵因素。環(huán)狀RNAs(circRNAs)是新發(fā)現的非編碼RNAs,在RNA調控中發(fā)揮重要作用。本研究基于OVX+E2模型探討光周期對綿羊甲狀腺的影響機制,為研究光周期調控綿羊季節性發(fā)情奠定理論基礎。
該研究通過(guò)全轉錄組測序對三種不同光周期下OVX+E2母羊甲狀腺中的circRNA圖譜進(jìn)行了全面分析,共檢測到37470個(gè)新的circRNAs,其中817個(gè)circRNAs有差異表達。對差異表達circRNAs進(jìn)行功能富集注釋分析,發(fā)現主要在肌醇磷酸代謝、cGMP-PKG信號通路、鈣信號通路、MAPK信號通路和卵細胞減數分裂等與繁殖相關(guān)的通路富集。同時(shí)構建ceRNA網(wǎng)絡(luò )互作圖,分析揭示了差異cirRNA的miRNA目標結合位點(diǎn),如oar-miR-10b、oar-miR-200c、oar-miR-21、oar-miR-370-3p、oar-miR-377-3p、oar-miR-181a、oar-miR-432和oar-miR-495-3p。本研究結果為闡明circRNA功能以及不同環(huán)境下綿羊甲狀腺作用提供了一些新的信息。
本研究得到國家自然科學(xué)基金、國家肉羊產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系和中國農業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng )新工程等支持。碩士研究生王唯和助理研究員賀小云為文章第一作者,儲明星研究員為通訊作者。
原文鏈接:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fendo.2022.974518/full