近日,上海交通大學(xué)農業(yè)與生物學(xué)院周培教授團隊在生態(tài)環(huán)境領(lǐng)域國際著(zhù)名期刊Journal of Hazardous Materials(中科院一區 Top)在線(xiàn)發(fā)表了題為Comparative cytology combined with transcriptomic and metabolomic analyses of Solanum nigrum L. in response to Cd toxicity的研究論文。研究利用植物細胞學(xué)、轉錄組學(xué)和代謝組學(xué)方法分析超富集植物龍葵對短期不同濃度鎘(Cd)脅迫的響應變化,探討了龍葵對Cd脅迫的應對機制。該研究結果為Cd脅迫相關(guān)的轉錄調控提供新視野,從而為生態(tài)環(huán)境中重金屬污染植物修復技術(shù)應用提供了重要借鑒。
土壤Cd污染是一個(gè)嚴重的全球性生態(tài)環(huán)境問(wèn)題,中國、日本、歐美等國家的耕地都存在不同程度的Cd污染現象。土壤Cd污染植物修復技術(shù)因具有環(huán)境友好、成本低廉、操作簡(jiǎn)便、視覺(jué)美觀(guān)等優(yōu)點(diǎn)被公眾所關(guān)注,而超富集植物龍葵常被用于Cd污染土壤修復。課題組前期研究發(fā)現Cd脅迫下龍葵通過(guò)調節體內抗氧化酶活、細胞壁多糖組分、Cd的亞細胞分布及賦存化學(xué)形態(tài)來(lái)抵御Cd毒害(https://doi.org/10.1016/j.ecoenv.2019.109997; https://doi.org/10.1007/s11356-020-11505-5)。然而,龍葵對Cd的高耐受性及解毒分子機制尚不清晰。因此,需要結合多組學(xué)技術(shù)研究龍葵對Cd脅迫的應答機制。
該論文研究采用水培試驗對龍葵進(jìn)行不同濃度Cd脅迫處理,重點(diǎn)研究了Cd脅迫下,龍葵各器官(根、莖、葉)細胞超微結構變化,并對根組織進(jìn)行轉錄組學(xué)與代謝組學(xué)聯(lián)合分析。通過(guò)透射電鏡(TEM)發(fā)現,Cd脅迫嚴重破壞了龍葵各器官細胞超微結構,且受損程度與Cd脅迫濃度呈濃度-劑量效應。此外,龍葵各器官細胞采取增厚細胞壁、將胞內Cd2+轉運至液泡等方式進(jìn)行解毒。
隨后,對龍葵根系進(jìn)行代謝組學(xué)與轉錄組學(xué)分析。代謝組學(xué)分析結果發(fā)現Cd脅迫下龍葵根系有7條代謝通路被顯著(zhù)干擾,涉及19個(gè)差異表達代謝物(DEMs)。而轉錄組學(xué)分析結果鑒定出3908個(gè)共同差異表達基因(DEGs),其中上調DEGs 1049個(gè),下調DEGs 2859個(gè)。除此之外,該研究利用組學(xué)聯(lián)合分析還發(fā)現了Cd脅迫下參與根組織細胞壁生物合成的DEMs和DEGs,初步揭示了細胞壁在龍葵根系解毒Cd過(guò)程中發(fā)揮的重要作用。
上海交通大學(xué)農業(yè)與生物學(xué)院生態(tài)學(xué)博士生王軍才為論文第一作者, 周培教授為通訊作者, 博士后初少華、張丹副研究員等參與了該研究。課題組多年來(lái)一直從事農業(yè)產(chǎn)地環(huán)境污染防治與修復方面的研究,并在Journal of Hazardous Materials、Environmental Pollution、Bioresource Technology、Science of The Total Environment等國內外權威期刊發(fā)表多篇論文。相關(guān)研究得到國家重大研發(fā)計劃和國家自然科學(xué)基金等項目支持。
論文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2021.127168