近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所經(jīng)濟(jì)作物真菌病害流行監(jiān)測與防控創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在國際知名期刊《微生物學(xué)波譜(Microbiology Spectrum)》上在線發(fā)表題為“Functional genomics and comparative lineage-Specific region analyses reveal novel insights into race divergence in Verticillium dahliae ”的研究論文,首次鑒定出大麗輪枝菌3號生理小種無毒基因,并研發(fā)了鑒定大麗輪枝菌3號生理小種的分子檢測技術(shù)。
由大麗輪枝菌引起的黃萎病嚴(yán)重威脅全球農(nóng)作物生產(chǎn)安全,年均直接經(jīng)濟(jì)損失數(shù)十億美元,極難防控。傳統(tǒng)上,依據(jù)番茄對大麗輪枝菌的抗性分為3個生理小種,1號和2號生理小種無毒基因已經(jīng)得到鑒定并應(yīng)用于田間病原分子流行監(jiān)測,但3號生理小種無毒基因一直未被發(fā)現(xiàn),嚴(yán)重制約了對3號生理小種與寄主互作機(jī)制的理解和分子檢測技術(shù)的研發(fā)。
本研究在系統(tǒng)解析大麗輪枝菌3個生理小種基因組及其遺傳變異的基礎(chǔ)上,發(fā)現(xiàn)大麗輪枝菌3個生理小種的信號調(diào)控因子(轉(zhuǎn)錄因子)發(fā)生了顯著分化,同時(shí)各個生理小種相對于其他2個生理小種均有基因家族發(fā)生擴(kuò)增;通過對3個生理小種基因組特異基因集的篩選與遺傳學(xué)驗(yàn)證,鑒定出3號生理小種無毒基因( VdR3e ),并在此基礎(chǔ)上研發(fā)了大麗輪枝菌3號生理小種分子檢測技術(shù)。相關(guān)研究拼上了大麗輪枝菌生理小種種群分化和無毒基因鑒定的重要“版圖”,也為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)實(shí)踐中大麗輪枝菌生理小種監(jiān)測和寄主抗性資源挖掘與應(yīng)用提供了重要的理論和技術(shù)支撐。
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所經(jīng)濟(jì)作物真菌病害流行監(jiān)測與防控創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)戴小楓研究員、陳捷胤研究員和美國加州大學(xué)戴維斯分校Krishna Subbarao教授為論文的共同通訊作者,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所博士后王丹為論文的第一作者,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所劉磊副研究員參與了此項(xiàng)工作。該研究得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程等項(xiàng)目的資助。
原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34937170/
大麗輪枝菌3號生理小種無毒基因鑒定和分子標(biāo)記開發(fā)