近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院果樹(shù)研究所蘋(píng)果資源與育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)蘋(píng)果資源課題組研究揭示非編碼RNA在蘋(píng)果根系、韌皮部、葉片、花和果實(shí)中的表達(dá)特性,揭示通過(guò)結(jié)合mdm-miR482可在蘋(píng)果不同組織中具抗逆作用的多個(gè)lncRNA和circRNA,發(fā)現(xiàn)circRNA: Chr00:18744403|18744580通過(guò)與mdm-miR16相互作用可參與花器官的形態(tài)建成和著色;lncRNA:MSTRG.60895.2可作為mdm-miR393的模擬靶標(biāo)調(diào)控MD17G1009000的表達(dá),它可能在蘋(píng)果果實(shí)的花青素代謝中具重要作用。相關(guān)成果發(fā)表在《基因(Genes)》和《國(guó)際分子科學(xué)(International Journal of Molecular Sciences)》上。
非編碼RNA作為近年來(lái)的研究熱點(diǎn),可直接調(diào)控mRNA的表達(dá),亦可通過(guò)結(jié)合miRNA進(jìn)而調(diào)控mRNA的表達(dá),在植物的形態(tài)建成、生物和非生物逆境中具重要的調(diào)控作用。
該研究從蘋(píng)果5個(gè)主要組織中鑒定得到6495個(gè)circRNA和9440個(gè)lncRNA,獲得不同組織中特異表達(dá)的lncRNA和circRNA,通過(guò)功能預(yù)測(cè),miRNA靶位點(diǎn)預(yù)測(cè)等手段,獲得特異表達(dá)lncRNA和circRNA在組織的特異表達(dá)特性和功能,以上結(jié)果為非編碼RNA在蘋(píng)果不同組織的功能解析奠定了基礎(chǔ)。
原文標(biāo)題:expression Characteristics in Roots, Phloem, Leaves, Flowers and Fruits of Apple circRNA