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中國科學(xué)院植物所揭示穗發(fā)育的關(guān)鍵調(diào)控因子及網(wǎng)絡(luò)

放大字體  縮小字體 時間:2023-11-21 08:51 來源:中國科學(xué)院 原文:
核心提示:中國科學(xué)院植物研究所郭自峰研究組利用六棱大麥測序品種Morex繪制了穗部發(fā)育的時空轉(zhuǎn)錄組圖譜。
  大麥(Hordeum vulgare L.)是重要的谷物,也是最古老的作物之一,屬禾本科大麥屬。大麥的花序為穗狀花序,著生于莖稈頂部,由中央的花序軸和兩側(cè)的小穗所組成。大麥穗發(fā)育復(fù)雜,且不同位置的小穗發(fā)育不均等,中間部位發(fā)育較快,兩端較慢。在穗發(fā)育過程中,單個穗子頂端和底部約30%-50%的小穗/小穗原基會發(fā)生退化,導(dǎo)致潛在籽粒數(shù)的損失。因此,研究大麥穗部的發(fā)育過程對于揭示花器官發(fā)育的生物學(xué)問題和提高大麥產(chǎn)量具有重要意義。
 
  中國科學(xué)院植物研究所郭自峰研究組利用六棱大麥測序品種Morex繪制了穗部發(fā)育的時空轉(zhuǎn)錄組圖譜。該圖譜覆蓋大麥穗部發(fā)育的17個階段。各階段的小穗從上到下分為5個部位——頂部、中上部、中部、中下部和底部。每個部位設(shè)置3個重復(fù),共255個樣本。科研人員分析這些樣本的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn),在5個部位共同表達的基因9228個,且根據(jù)表達模式分為15個cluster。不同cluster的表達峰值分布在不同的發(fā)育時期,調(diào)控小穗不同的發(fā)育過程。同時,該研究對所有cluster中的轉(zhuǎn)錄因子、激素相關(guān)基因和已知功能基因的進行相關(guān)性分析,發(fā)現(xiàn)了重要的節(jié)點基因,如編碼海藻糖-6-磷酸磷酸酶(TPP)的HvTPP7基因、SHI家族轉(zhuǎn)錄因子VRS2及MADS家族轉(zhuǎn)錄因子HvAGL6基因等。這些基因可能在表達峰值時期參與重要的調(diào)控功能。研究對不同部位的差異表達分析發(fā)現(xiàn),頂部位置的差異基因高達1043個,包含衰老相關(guān)蛋白、生長素和BR途徑、植物特有的LOB轉(zhuǎn)錄因子家族等基因。
 
  基于這一表達譜,科研人員鑒定到一個編碼GDSL脂肪酶的HvGELP96基因。它在黃色花藥期特異高表達,是大麥小穗育性和粒數(shù)的重要調(diào)控因子。轉(zhuǎn)錄圖譜的發(fā)布,為研究大麥的穗部發(fā)育提供了豐富的信息資源。
 
  11月15日,相關(guān)研究成果在線發(fā)表在《細(xì)胞報告》(Cell Reports)上。
日期:2023-11-21
 
 地區(qū): 中國
 行業(yè): 糧油
 標(biāo)簽: 大麥
 科普: 大麥
 
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