近日,中國水產(chǎn)科學(xué)研究院北戴河中心實驗站牙鲆遺傳育種創(chuàng)新團隊在牙鲆無眼側(cè)黑化性狀研究方面取得新進展,相關(guān)研究成果以“Identification candidate genes and loci associated with hypermelanosis of the blind side in Japanese flounder (Paralichthys olivaceus) using the combination of RNA-Seq and BSA-Seq”為題發(fā)表于《Aquaculture》(JCR 1區(qū)期刊,IF:3.9,全文網(wǎng)址為:https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2024.741583)。團隊劉名揚研究實習(xí)員、傘利擇研究實習(xí)員為第一作者,侯吉倫研究員、王桂興副研究員為通訊作者。
在牙鲆工廠化養(yǎng)殖過程中,無眼側(cè)皮膚黑化嚴(yán)重影響其經(jīng)濟價值。雌核發(fā)育作為一種可有效提升遺傳同質(zhì)性并固定特定性狀的技術(shù),被廣泛地應(yīng)用于魚類遺傳育種研究中。在本研究中,團隊利用雌核發(fā)育技術(shù)制備了正常和無眼側(cè)皮膚黑化牙鲆的重組雙倍體群體,構(gòu)建了皮膚轉(zhuǎn)錄組文庫和BSA-seq的分離池(Po_N和Po_H)。通過RNA-seq和BSA-seq相結(jié)合,篩選到5個InDel和3個SNP,經(jīng)204尾個體基因型驗證和qRT-PCR實驗證明候選基因ca4a和mreg中的3個位點與該性狀顯著相關(guān)。研究結(jié)果為解析牙鲆無眼側(cè)黑化的分子機制以及全白底板牙鲆的選育提供了重要的支撐。
本研究得到中國水產(chǎn)科學(xué)研究院基本科研業(yè)務(wù)費(2023TD41)、河北省重點研發(fā)計劃(21326307D)、河北省自然科學(xué)基金(C2023107012)、國家海水魚產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-47)和國家海洋水產(chǎn)種質(zhì)資源庫等項目的資助。