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安徽師范大學(xué)錢葉雄教授課題組在玉米逆境生物學(xué)及抗逆基因挖掘方面取得新進(jìn)展

放大字體  縮小字體 時間:2022-09-27 08:27 來源:安徽師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 原文:
核心提示:近期,錢葉雄教授課題組在植物科學(xué)領(lǐng)域國際知名學(xué)術(shù)期刊《Frontiers in Plant Science》(IF=6.627,中科院二區(qū)TOP期刊)上發(fā)表兩篇研究論文,以及在基因組學(xué)領(lǐng)域國際知名學(xué)術(shù)期刊《BMC Genomics》(IF5=4.931,中科院二區(qū)TOP期刊)上發(fā)表1篇研究論文。
  近期,錢葉雄教授課題組在植物科學(xué)領(lǐng)域國際知名學(xué)術(shù)期刊《Frontiers in Plant Science》(IF=6.627,中科院二區(qū)TOP期刊)上發(fā)表“ZmNAC074, a maize stress-responsive NAC transcription factor, confers heat stress tolerance in transgenic Arabidopsis”和“Genome-Wide Identification and Functional Analysis of Polyamine Oxidase Genes in Maize Reveal Essential Roles in Abiotic Stress Tolerance”兩篇研究論文,以及在基因組學(xué)領(lǐng)域國際知名學(xué)術(shù)期刊《BMC Genomics》(IF5=4.931,中科院二區(qū)TOP期刊)上發(fā)表“Genome-wide Identification and expression Profiling Analysis of Maize AP2/ERF Superfamily Genes Reveal Essential Roles in Abiotic Stress Tolerance”的研究論文。2020級碩士研究生席燕以及2021屆碩士畢業(yè)生張靜分別為論文的第一作者,錢葉雄教授為論文的通訊作者,安徽師范大學(xué)作為論文的第一作者及通訊作者單位。
 
  高溫等惡劣環(huán)境極大地限制了全球農(nóng)作物的生長、發(fā)育和生產(chǎn)。NAC轉(zhuǎn)錄因子是一類重要的轉(zhuǎn)錄因子,在植物的非生物逆境脅迫響應(yīng)中起著關(guān)鍵的調(diào)節(jié)作用。然而,NAC轉(zhuǎn)錄因子在玉米熱脅迫反應(yīng)中的功能尚不清楚。本研究前期鑒定并克隆了一個玉米逆境反應(yīng)NAC轉(zhuǎn)錄因子基因,命名為ZmNAC074。進(jìn)一步研究表明,ZmNAC074可能編碼玉米NAC家族的一個膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子(MTF),由517個氨基酸殘基組成,C端存在一個跨膜區(qū)。此外,ZmNAC074在玉米幼苗中高度表達(dá),并受到各種非生物脅迫的誘導(dǎo),特別是在高溫脅迫下的葉片組織中。進(jìn)一步通過轉(zhuǎn)基因方法對ZmNAC074進(jìn)行功能驗(yàn)證,通過表型和生理分析表明,ZmNAC074在轉(zhuǎn)基因擬南芥中的過表達(dá)可以調(diào)節(jié)多種脅迫代謝產(chǎn)物的積累,包括活性氧(ROS)、抗氧化劑、丙二醛(MDA)、脯氨酸、可溶性蛋白、葉綠素和類胡蘿卜素的含量的變化,顯著提高了植物的耐熱能力。實(shí)時熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)分析表明,在熱脅迫條件下,轉(zhuǎn)基因擬南芥中編碼抗氧化物清除酶以及HSR和UPR通路反應(yīng)相關(guān)基因的表達(dá)水平顯著上調(diào),表明ZmNAC074可能編碼一個熱脅迫正調(diào)控因子,激活ROS清除基因和HSR和UPR通路相關(guān)基因的表達(dá),從而提高植物在熱脅迫條件下的耐熱性。總之,ZmNAC074可能在賦予植物耐熱性方面發(fā)揮重要調(diào)控作用,為玉米和其他作物耐熱性調(diào)控機(jī)制研究以及培育抗高溫作物新品種提供關(guān)鍵候選基因。該研究成果目前已發(fā)表在近期《Frontiers in Plant Scienc》期刊上,文章鏈接: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2022.986628。
 
  多胺(PA)在植物的生長發(fā)育和非生物脅迫中發(fā)揮著重要作用。多胺氧化酶(PAO)是黃素腺嘌呤二核苷酸依賴的酶,在多胺的分解代謝中起重要作用。該研究通過全基因組分析方法首次對玉米PAO基因進(jìn)行了全基因組篩選,鑒定了9個ZmPAO基因,命名為ZmPAO1-9,利用生物信息學(xué)方法對其系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系、基因和蛋白結(jié)構(gòu)、順式作用元件、染色體分布位置及基因復(fù)制等方面進(jìn)行了系統(tǒng)地研究。通過對轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析,構(gòu)建了玉米ZmPAO基因家族在不同生長發(fā)育時期和不同發(fā)育組織的全基因組基因表達(dá)譜,并通過qPCR方法驗(yàn)證了ZmPAO基因響應(yīng)高溫、干旱和鹽脅迫,表明這些基因在這些非生物脅迫反應(yīng)中可能發(fā)揮作用。最后,通過構(gòu)建過表達(dá)ZmPAO6基因的轉(zhuǎn)基因擬南芥驗(yàn)證ZmPAO基因在植物中的調(diào)控功能。揭示ZmPAO6的過表達(dá)可能通過介導(dǎo)多胺的分解代謝來增強(qiáng)轉(zhuǎn)基因植株的耐熱性,從而減少了熱脅迫下H2O2和MDA的積累,減緩了葉綠素的降解,表明ZmPAO6可以通過參與多種生理過程來提高轉(zhuǎn)基因植株的耐熱性。此外,谷胱甘肽過氧化物酶(GPX)和抗壞血酸過氧化物酶(APX)等抗氧化酶相關(guān)基因的表達(dá)分析表明,ZmPAO6可能通過調(diào)節(jié)熱脅迫誘導(dǎo)下的H2O2在多胺分解代謝中的積累來提高轉(zhuǎn)基因植株的耐熱性。綜上所述,該研究首次報(bào)道了ZmPAO6基因?qū)χ参餆崦{迫的響應(yīng),為進(jìn)一步揭示ZmPAO基因在玉米生長發(fā)育和適應(yīng)非生物脅迫中的功能和調(diào)控機(jī)制提供了重要的理論依據(jù)。該研究成果目前已發(fā)表在近期《Frontiers in Plant Science》期刊上,文章鏈接:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/ fpls.2022.950064。
 
  AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子超家族作為植物中最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,參與了多種生物學(xué)過程,在植物的生長發(fā)育和應(yīng)對各種逆境脅迫的響應(yīng)中發(fā)揮著重要作用。盡管AP2/ERF超家族基因在許多植物中已被報(bào)道,但目前對玉米AP2/ERF基因的結(jié)構(gòu)和功能知之甚少。根據(jù)玉米B73基因組的AGPv4版本,鑒定出214個編碼ZmAP2/ERF蛋白的基因。根據(jù)AP2/ERF結(jié)構(gòu)域的數(shù)目及其蛋白氨基酸序列的相似性,鑒定的214個玉米ZmAP2/ERF蛋白被劃分為三個不同的家族,分別包括AP2家族(44個)、ERF家族(166個)和RAV家族(4個)。其中,ERF家族被進(jìn)一步細(xì)分為兩個不同的亞家族,包括DREB和ERF亞家族,分別含有61和105個成員。此外,進(jìn)一步地根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育分析,DREB和ERF亞家族成員分別被分為4個(組I-IV)和8個(組V-XII)。通過對這些ZmAP2/ERF基因的外顯子-內(nèi)含子結(jié)構(gòu)特征及其編碼的ZmAP2/ERF蛋白的保守蛋白質(zhì)基序分析,結(jié)果與類群劃分保持高度一致。啟動子分析表明,ZmAP2/ERF基因具有許多脅迫和激素相關(guān)的順式調(diào)控元件。基因復(fù)制和共線性分析表明,串聯(lián)或片段復(fù)制和純化選擇在3個不同的禾本科植物(玉米、水稻和高粱) AP2/ERF超家族基因之間的進(jìn)化以及功能分化中發(fā)揮重要作用。轉(zhuǎn)錄組分析表明,大多數(shù)ZmAP2/ERF基因在玉米不同生長發(fā)育階段表現(xiàn)出不同的差異表達(dá)模式。此外,對ZmAP2/ERF基因之間的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)以及ZmAP2和ZmERF蛋白之間的蛋白質(zhì)相互作用進(jìn)行分析,揭示了玉米AP2/ERF超家族成員之間內(nèi)在調(diào)控關(guān)系。此外,進(jìn)一步通過實(shí)時定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)證實(shí)了27個ZmAP2/ERF基因?qū)?種不同的非生物脅迫的存在響應(yīng),表明它們在不同的非生物脅迫響應(yīng)中具有潛在的調(diào)控功能。綜上所述,這些研究結(jié)果表明玉米ZmAP2/ERF基因在非生物脅迫耐受性中起著重要的調(diào)控作用。該研究成果目前已發(fā)表在近期《BMC Genomics》期刊上,文章鏈接:https://doi.org/10.1186/s12864-022-08345-7。
 
  以上論文得到了國家自然科學(xué)基金(31571673)、安徽省高校學(xué)科(專業(yè))拔尖人才學(xué)術(shù)資助項(xiàng)目(gxbjZD2021044)、安徽省學(xué)術(shù)和技術(shù)帶頭人后備人選資助計(jì)劃(2020H221)以及重要生物資源保護(hù)與利用安徽省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放基金(swzy202003)等項(xiàng)目支持。
日期:2022-09-27
 
 地區(qū): 安徽 中國
 行業(yè): 轉(zhuǎn)基因食品 食品檢測 糧油
 標(biāo)簽: 生物 玉米 基因
 科普: 生物 玉米 基因
 
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