11月20日，由農業(yè)農村部科技教育司指導、中國農業(yè)科學(xué)院、中國農學(xué)會(huì )、農業(yè)農村部科技發(fā)展中心聯(lián)合主辦的2020年中國農業(yè)農村科技發(fā)展高峰論壇在南京舉行。論壇上發(fā)布了《2020中國農業(yè)科學(xué)重大進(jìn)展》，南京農業(yè)大學(xué)張紹鈴教授團隊研究成果“高雜合物種單倍型基因組組裝的新方法”成功入選。

 

　　植物基因組組裝大多采用二倍體或者多倍體材料進(jìn)行混合測序并組裝，對于一些雜合度低和重復序列比例少的物種而言，單倍型基因組組裝的難度并不是很凸顯，但是對于一些自交親和及高雜合的物種，單倍型染色體之間的差異會(huì )導致最終基因組存在大量嵌合組裝，而利用這種嵌合基因組將不利于這些物種的后續重測序、進(jìn)化、基因功能等方面的研究。

 

　　張紹鈴教授團隊在成功組裝了世界首個(gè)梨基因組精細圖譜及變異圖譜的基礎上，利用12個(gè)花粉單細胞對所構建的3.8萬(wàn)條人工染色體（BAC，bacterial artificial chromosome）進(jìn)行單倍型分型，創(chuàng )建了基于“條形-編碼”（Bar-coding）的單倍型基因組組裝方法，成功組裝了梨兩套單倍型基因組。通過(guò)這種方法鑒定出了原參考基因組中8.12%的由于雜合引起的嵌合組裝基因，并對所測的‘碭山酥梨’基因組兩個(gè)單倍型之間的差異進(jìn)行了系統分析。同時(shí)，這種方法不僅可以利用花粉單細胞測序對BAC進(jìn)行分型，也可以結合多種長(cháng)讀長(cháng)測序技術(shù)（如Pacbio）用于解決復雜植物基因組的單倍型基因組組裝難題，有助于推動(dòng)農作物及經(jīng)濟作物等植物基因組的研究。

 

　　該研究成果于2019年10月在基因組研究權威期刊《Genome Research》上發(fā)表，南京農業(yè)大學(xué)為第一完成單位，張紹鈴教授為通訊作者，南京農業(yè)大學(xué)博士生施冬青為論文第一作者，吳俊教授、殷豪副教授以及福建農林大學(xué)唐海寶教授為共同第一作者，吳巨友教授、陶書(shū)田教授、齊開(kāi)杰老師、謝智華老師參與了該研究工作，并得到了國家重點(diǎn)研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項目的資助。

 

　　中國農業(yè)科學(xué)重大進(jìn)展每年評選一次，遴選時(shí)以我國各類(lèi)科研機構正式發(fā)表的農業(yè)領(lǐng)域高水平科學(xué)研究論文為基礎，根據“前沿引領(lǐng)、開(kāi)創(chuàng )卓越、重大突破”的原則，經(jīng)過(guò)初選、專(zhuān)家評審及推薦、綜合遴選、解讀發(fā)布等過(guò)程，最終選出10項能夠充分代表當年我國農業(yè)科技前沿研究水平的基礎科學(xué)研究成果。