近日，中國水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所珠江漁業(yè)資源調查與評估創(chuàng )新團隊在國際分子生態(tài)學(xué)領(lǐng)域經(jīng)典刊物《Molecular Ecology》（IF2021=6.185，中科院生物學(xué)TOP1區）發(fā)表了題為“Large-scale DNA barcoding of the subfamily Culterinae （Cypriniformes: Xenocyprididae） in East Asia unveils a geographical scale effect, taxonomic warnings and cryptic diversity”【中文題目：大尺度DNA條形碼研究揭示了東亞地區鲌亞科魚(yú)類(lèi)的地理尺度效應、分類(lèi)警示和隱存多樣性】的研究論文。該研究得到國家重點(diǎn)研發(fā)計劃藍色糧倉重點(diǎn)專(zhuān)項（2018YFD0900902和2018YFD0900903）、中國水產(chǎn)科學(xué)研究院基本科研業(yè)務(wù)費（2020TD-10 and 2020ZJTD-04）等項目資助。珠江所為論文第一完成單位，陳蔚濤助理研究員為論文的第一作者，Nicolas Hubert教授和李捷研究員為論文的通訊作者。

 

　　DNA條形碼技術(shù)是分類(lèi)學(xué)研究的重要輔助手段，早期的大部分DNA條形碼研究局限于相對狹小的地理尺度范圍，因此大部分研究結果均支持分子與形態(tài)的高匹配率。然而，地理尺度的擴大將攜帶更多的遺傳變異，可能導致同一物種的種內遺傳距離將會(huì )變大、不同物種之間的種間遺傳距離變小，進(jìn)而影響DNA條形碼的有效性（種內、種間遺傳距離是DNA條形碼鑒定成功與否的關(guān)鍵參數）。目前，關(guān)于地理尺度對DNA條形碼有效性影響方面的證據極其匱乏，在水生生物方面更是鮮見(jiàn)報道。珠江所與法國發(fā)展研究所、海南省海洋與漁業(yè)科學(xué)研究院、河南師范大學(xué)等單位合作，在東亞地區116個(gè)采樣站位獲得了42種（亞種）鲌亞科魚(yú)類(lèi)共計1511條條形碼序列，綜合遺傳距離估算、方差分析、物種界定分析、系統發(fā)育分析等手段，首次揭示了地理尺度對水生生物類(lèi)群DNA條形碼有效性的影響，探討了東亞地區鲌亞科魚(yú)類(lèi)在分類(lèi)上存在的潛在問(wèn)題，挖掘了了隱存多樣性并討論了隱存多樣性形成的可能機制。結果表明，地理尺度分別與種內、種間遺傳距離呈正、負相關(guān)關(guān)系，證實(shí)了地理尺度將通過(guò)縮小條形碼間隙來(lái)影響DNA條形碼的有效性。另外，DNA條形碼共界定44個(gè)分子可操作單元（MOTU），成功鑒定的物種數僅為17，成功率僅約為40%，顯著(zhù)低于早期大部分研究的鑒定成功率。未成功識別的25個(gè)物種中，低水平的種間分化和（或）譜系混合導致18個(gè)物種僅形成9個(gè)MOTUs，不僅挑戰了分子鑒定方法的可行性，還對這些物種的進(jìn)化起源提出了質(zhì)疑；此外，生物地理屏障與上新世和更新世的地質(zhì)事件促進(jìn)8個(gè)物種分別形成2-4個(gè)MOTUs，表明傳統分類(lèi)可能?chē)乐氐凸懒索垇喛频纳锒鄻有浴Ｑ芯拷Y果為鲌亞科魚(yú)類(lèi)后期的分類(lèi)和遺傳學(xué)等相關(guān)研究提供了重要指引，同時(shí)為該類(lèi)群的多樣性保護和種質(zhì)資源開(kāi)發(fā)提供了重要啟示。

 

　　文章鏈接：https://doi.org/10.1111/mec.16540